Ученые ФИЦ «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН обнаружили в сточных водах Москвы гены устойчивости к антибиотикам

Российские ученые показали, что очистные сооружения Москвы позволяют с высокой эффективностью удалять потенциально опасные бактерии из сточных вод. Очистка помогает сократить число генов устойчивости к антибиотикам в общем генетическом материале микроорганизмов сточных вод в 3–4 раза, что сопоставимо с эффективностью очистки в других мегаполисах мира. Однако даже в прошедшей обработку воде были обнаружены гены устойчивости ко многим широко используемым антибиотикам. Гены резистентности способствуют тому, что бактерии становятся нечувствительны к лекарствам, поэтому ученые отслеживают риск их распространения.

Результаты исследования, поддержанного грантом Российского научного фонда, опубликованы в журнале Scientific reports.

Плохо контролируемое и нерациональное использование антибиотиков в медицине, ветеринарии и сельском хозяйстве приводит к распространению бактериальных штаммов, устойчивых к антибиотикам, в том числе обладающих множественной лекарственной устойчивостью. Это, в свою очередь, препятствует эффективному лечению инфекционных болезней у людей и сельскохозяйственных животных и может стать причиной эпидемий. Один из основных источников устойчивых к лекарствам бактерий — сточные воды, поскольку в них попадает большинство антибиотиков, не усвоенных и выведенных из организма естественным образом. Более того, очистные сооружения, в которые поступают сточные воды, оказываются «горячими точками» для формирования устойчивых штаммов, потому что здесь микробы, способные обмениваться генетическим материалом, передают друг другу гены антибиотикорезистентности.

Ученые из Федерального исследовательского центра (ФИЦ) «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН (Москва) исследовали содержание генов устойчивости к антибиотикам в общем генетическом материале микроорганизмов сточных вод Москвы до и после их очистки.

Московские очистные станции ежедневно обрабатывают около 6 млн. м3 воды, и очищенные сточные воды сбрасываются в реку Москва, составляя половину ее стока. В исследовании авторы изучили две крупные станции из комплекса Люберецких очистных сооружений АО «Мосводоканал», ответственные за обработку городских сточных вод.

В первую очередь биологи сравнили видовой состав микробных сообществ в сточных водах до и после очистки. Оказалось, что микроорганизмы — фекальные загрязнители и потенциальные патогены — удаляются на очистных сооружениях Москвы с высокой эффективностью: их концентрация в воде после очистки снижается в десятки тысяч раз.

Затем авторы проанализировали весь генетический материал, содержащийся в московских сточных водах. Это позволило выявить бактериальные гены, отвечающие за устойчивость к антибиотикам. В необработанных сточных водах исследователи обнаружили несколько сотен генов, способных обеспечить устойчивость к наиболее широко используемым классам антибиотиков: бета-лактамам, к которым относится пенициллин, макролидам (например, эритромицину), аминогликозидам (например, гентамицину), тетрациклинам (например, доксициклину), сульфаниламидам (например, стрептоциду) и четвертичным аммониевым соединениям, используемым в средствах для дезинфекции.

Ученые рассчитали, что в среднем в неочищенной московской сточной воде на один бактериальный геном (то есть условно на одну бактерию) приходится 1–2 гена устойчивости к антибиотикам, тогда как после обработки воды их доля в общем генетическом материале бактерий снижается примерно в 3–4 раза. Тем не менее, даже в прошедшей все стадии очистки сточной воде были обнаружены гены устойчивости ко многим широко используемым антибиотикам. Ни одни очистные сооружения мира не способны полностью удалить эти генетические последовательности из сточных вод, и, согласно литературным данным, эффективность очистки в Москве сопоставима с мегаполисами других европейских стран.

«Мы получили только первые данные о том, какие гены лекарственной устойчивости поступают в реку Москва со сточными водами. На следующем этапе мы сравним содержание устойчивых к антибиотикам бактерий и генов устойчивости в реке Москва в разных точках выше и ниже по течению от города, чтобы выявить источники загрязнения. Мы проанализируем метагеном речной воды ниже по течению реки, вплоть до места ее впадения в Оку, чтобы посмотреть, насколько эффективна самоочистка речной воды», — рассказывает руководитель проекта Шахжахон Бегматов, кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории геномики микроорганизмов и метагеномики института биоинженерии ФИЦ «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН.

Схема исследования: Шахжахон Бегматов

Источник: пресс-служба Российского научного фонда